工(gōng )藤新一是全国著名的高中(zhōng )生侦(zhēn )探，在一次追查(chá )黑(hēi )衣人(rén )犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药(yào )水，工藤新一变回了小孩！新一找到了经常(cháng )帮助(zhù )他的阿笠(lì )博士，博士为他度身打(dǎ )造不少间谍武器(qì )。为(wéi )了防止犯罪团(tuán )伙对他进行报(bào )复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望(wàng )能得(dé )到解(jiě )药。一日，新一 的女友毛(máo )利兰来(lái )到(dào )了阿笠博士的(de )家寻(xún )找男(nán )友的下落，被小兰撞见的新一情急之下编造了(le )自己名叫江户川柯南，随后柯(kē )南寄居在(zài )了小兰(lán )家。小兰的父亲(qīn )毛利小五(wǔ )郎是一名(míng )私家(jiā )侦探，新一可以籍(jí )着和(hé )他一起四出(chū )办案一起追查黑夜人的下落。柯南(nán )在小学认识步美等小(xiǎo )学生，他们一起组织了一个(gè )少年侦探团，向罪犯宣战(zhàn )！