工藤(téng )新一是全国著名(míng )的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员(yuán )发现，击晕(yūn )后(hòu )喂了神奇的药水，工藤(téng )新一变回了小孩！新一找到(dào )了经常帮助他的阿笠博士，博(bó )士为他度身打造不少间谍武器(qì )。为了防止犯罪(zuì )团伙对他进(jìn )行报复，新一决定隐姓(xìng )埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得(dé )到解(jiě )药。一日，新(xīn )一 的(de )女(nǚ )友毛利兰来到了阿笠博(bó )士的家寻找男友的下(xià )落(luò )，被小兰(lán )撞见的新一情急之下编造了自己名(míng )叫(jiào )江户川柯南(nán )，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名(míng )私家(jiā )侦探(tàn )，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯(kē )南在(zài )小学认识步美(měi )等小(xiǎo )学(xué )生，他们一起(qǐ )组织(zhī )了一个少年(nián )侦探团，向罪(zuì )犯宣战！