工藤(téng )新(xīn )一是全(quán )国(guó )著名的(de )高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不(bú )幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工(gōng )藤(téng )新一变回了小孩！新(xīn )一找到(dào )了经(jīng )常(cháng )帮助(zhù )他的(de )阿笠(lì )博士，博士(shì )为他(tā )度身打造不少间谍武器。为了防止犯(fàn )罪团伙对他进行报复，新一决定隐姓埋名，暗中追查他们，希望能得到(dào )解药(yào )。一日(rì )，新一(yī ) 的女友毛利兰来到了阿笠博士的家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞(zhuàng )见的(de )新一情急之下编造了自己名叫江(jiāng )户川(chuān )柯南，随后(hòu )柯南(nán )寄居在了小兰家(jiā )。小兰的父(fù )亲毛利小五郎(láng )是一名私家侦探，新一可以籍(jí )着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们(men )一起组织了一(yī )个(gè )少年侦(zhēn )探团，向(xiàng )罪犯(fàn )宣战！