工藤新一(yī )是全(quán )国著名的高中生(shēng )侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水，工藤新一变回(huí )了小孩！新一找到了经常帮助他的阿笠博士(shì )，博士为他度身打造(zào )不少间谍(dié )武器。为了防止犯罪(zuì )团伙对(duì )他(tā )进行报复，新一决定隐(yǐn )姓埋名，暗中追查他们，希(xī )望能得到解药。一日，新一 的女友毛(máo )利(lì )兰(lán )来到了(le )阿笠博士的(de )家寻(xún )找男友的下落，被小兰撞见的新一情急之(zhī )下编造了自(zì )己名叫江户川柯(kē )南(nán )，随后(hòu )柯(kē )南寄居在了小(xiǎo )兰家。小(xiǎo )兰的父(fù )亲毛利小(xiǎo )五郎是一(yī )名私家(jiā )侦(zhēn )探，新(xīn )一可(kě )以籍着和他一(yī )起四出办案一起追(zhuī )查黑夜人的下落。柯(kē )南在小学认(rèn )识步美等小学生，他们一起组织了(le )一(yī )个少年(nián )侦探团，向(xiàng )罪犯宣战！